Existem dois protocolos usados pelo Diretório. O Protocolo de Acesso ao Diretório (PAD) é usado em interações entre um AUD e um ASD. Já o Protocolo do Sistema de Diretórios (PSD) é usado em interações entre dois ASD.
As operações do protocolo PAD são os Serviços do Diretório que podem ser solicitados por um usuário.
Com pequenas exceções, o PSD é muito similar ao PAD, já que é utilizado por ASDs que cooperam para responder um pedido de usuário. O PSD reside na camada de aplicação do nodelo OSI. Além das operações oferecidas pelo DAP, o DSP implementa ainda três outras operações:
As operações que ocorrem entre ASD são operações encadeadas, então os resultados produzidos por estas operações é um resultado encadeado. Os argumentos nestas operações são os mesmos do PAD, mais um argumento de encadeamento. Este argumento contém informação sobre o progresso da avaliação da operação que é necessária ao próximo ASD na cadeia.
Ambos os protocolos são baseados no conceito de operações remotas. O Diretório implementa operações remotas usando o elemento de serviço de operações remotas (ROSE - Remote Operation Service Element) que é a parte do nível de aplicação OSI. As operação de conectar e desconectar onstituem uma exceção. Elas usam o elemento de serviço de controle de associação (ACSE- Association Control Service Element), que é também parte do nível de aplicação.