Una debilidad potencial en todos los sistemas de encriptación es la necesidad de recordar la clave bajo la cual cualquier dato ha sido encriptado. Esto es similar al problema de recordar la contraseña.
Si la clave ha sido escrita y la llega a conocer una persona no autorizada, podrán leer sus datos originales. Si olvida la clave, entonces será incapaz de leer los datos originales.
Debe reconocerse que el método de RSA es mucho más lento de efectuar que el DES; el encriptamiento con una clave de por ejemplo 500 bits puede insumir tiempo de microprocesador. Las velocidades de procesamiento en cuestión eran varias veces menores hace unas década lo que se hizo inaceptable la adopción del RSA en más de un sistema.
Una consideración final de importancia en el diseño de sistemas de encriptado es que la seguridad debe estar fundamentada en la clave y ser independiente del conocimiento de cómo opera el algoritmo de encriptado.
Uno de los puntos claves en que basan la seguridad del método de encriptar DES es la baja probabilidad de romper el encriptado por métodos analíticos y/o estadísticos. (Confiabilidad).
Usa una clave de 56 bits que permite 72.000 billones de combinaciones. Se sugiere que el DES debería tener una clave mayor, tal vez de 112 bits.
Evidentemente, si un espía dispone de una algoritmos eficientes de factorización lo podrá utilizar para factorizar n, que es público, obteniendo los primos p y q, con lo cual poder quebrar el método RSA. (Confiabilidad). Este método provee seguridad (encriptación ) y autenticación.